生物反应器（bioreactor）: 利用酶或生物体（如微生物）所具有的生物功能，在体外进行生化反应的系统，它是一种生物功能模拟机，如发酵罐、固定化酶或固定化细胞反应器，各种细胞培养器和转基因动植物等。可用于制备或生产某些生物反应产物，有的可以作为生物传感器。
生物反应器历经了3个发展阶段，细菌基因工程、细胞基因工程及转基因动植物生物反应器。生物反应器基本原理相当简单。生物工程上的生物反应器是在体外模拟生物体的功能，设计出来用于生产或测试各种化学品的反应装置。或者说，生物反应器是利用酶或生物体（如微生物）所具有的生物功能，在体外进行生化反应的装置系统。在固定化酶广泛应用的基础上，人们发现天然细胞本身就具有多功能的系列化反应系统采用物理或化学方法将细胞固定化，是利用酶或酶系的一条捷径。一个固定化细胞反应器犹如一台“生命活动功能推动机”。固定化细胞技术开始于７０年代，其实际应用程度已超过固定化酶。如美国、欧洲、日本均采用固定化菌体柱床工艺大规模生产高果糖浆。
而植物生物反应器是指通过基因工程途径，以常见的农作物作为“化学工厂”，通过大规模种植生产具有高经济附加值的医用蛋白、工农业用酶、特殊碳水化合物、生物可降解塑料、脂类及其它一些次生代谢产物等生物制剂的方法。
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